Auszug aus dem Historischen Ortsnamensbuch:

Bei der ersten Erwähnung des Ortsnamens Mauggen nannte man den Ort "Muchun", was nach mundartlichen Belegen auf das indogermanische "meng" zurückzuführen sein soll, was soviel wie nasses, sumpfiges Gelände bedeutete.

Im 12. Jahrhundert wurde es "Muchen" genannt.
Im 13. Jahrhundert wurde "Mukken" geschrieben.
In der Mitte des 14. Jahrhunderts nannte man die Ortschaft "Mauchen".
1385 schrieb man "Maukchen".
1403 kann man "Mewkhen" nachlesen.
1437 tauchte dann der Name "Maucken" auf.
1482 hieß es "Mauckn".
100 Jahre später, nämlich 1571, bezeichnete man die Ortschaft "Maugkhen", 1579 "Mauckn" und 1598 "Mauckhen".
300 Jahre später, um 1877, war der Ort als "Maucken" bekannt.
Erst Ende des 19., Anfang des 20. Jahrhunderts entwickelte sich die heutige Schreibweise "Mauggen".

Quelle: Ortschronik Mauggen, 1053-2003, Herausgegeben von der Ortschaft Mauggen im Rahmen der 950-Jahrfeier, im März 2003